Quick Start of KGZ
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零、DFT计算流程建模 建模方式：b 站啦啦黑还黑 软件：Materials Studio, [VESTA](Download - VESTA (jp-minerals.org)), ASE
参数设置 （VASP,CP2K） 文献SI查询
结果分析能量计算：
自由能$$G = E_{DFT} + E_{ZPE} – T*S$$
吸附能$$E_{ads} = E_{DFT} - E_{slab} – E_{molecule}$$电子结构分析：Bader charge，d/p带中心，pdos分析，COHP分析等
一、服务器使用服务器介绍计算平台：HPC of zheng操作系统：CentOS L ...
Learn SSD the hard way
一、基础知识
Notes-of-Ai
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Adobe illustrator封面
下载
https://mp.weixin.qq.com/s/HDEvISQCaL4rTvAwdsAGCw
创建画布
Origin，复制页面crtl j 复制到画布crtl v
编组选择（多选+编辑/移动）
改变边框粗细（字体加粗），描边
添加文字；取消占位符填充，编辑-首选项-文字 修改占位符，占位符设计原因
新增画板（多页）工具栏 窗口-画板-新建画板
Scripts of KGZ
Scripts of KGZ
本教程基于 HPC of zhenggroup 集群环境https://github.com/LU-SONG/Computational-Chemistry/blob/main/scripts/scripts.md
python脚本(2024)
-脚本名称-
-功能-
-使用方法-
add_H2O.py
Add H2O to the slab.
python3 add_H2O.py
add_site_ads.py
添加中间体的吸附位点，top/bridge/hollow
python3 add_site_ads.py -h
bader2pqr.py
将bader转化为pqr格式，可视化
python3 bader2pqr.py
ck-multi.py
查看串行脚本的运行情况
python3 ck-multi.py multi_job.pbs
d-band.py
d带中心分析（需要先做完pdos计算）
python3 d-band.py
plot_pdos.py
plot the projected den ...
Template
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Notes of datastructure
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第一章：初识算法算法（algorithm）数据结构（data structure）
生活中的二分法，排序，贪心算法：查字典，整理扑克，找零钱。
数据结构设计是一个充满权衡的过程。如果想在某方面取得提升，往往需要在另一方面作出妥协。
数据结构为算法提供了结构化存储的数据，以及操作数据的方法。数据结构本身仅存储数据信息，结合算法才能解决特定问题。算法通常可以基于不同的数据结构实现，但执行效率可能相差很大，选择合适的数据结构是关键。
在实际讨论时，我们通常会将“数据结构与算法”简称为“算法”。
第二章 复杂度分析渐近复杂度分析（asymptotic complexity analysis）
时间复杂度（time complexity）
重复操作：迭代（iteration）递归（recursion）
for 循环是最常见的迭代形式之一，适合在预先知道迭代次数时使用。while 循环比 for 循环的自由度更高。
每一次嵌套都是一次“升维”，将会使时间复杂度
迭代：“自下而上”地解决问题。从最基础的步骤开始，然后不断重复或累加这些步骤， ...
Hello World
9c6161198b65c0c7ed655745c399b5b33f07946e5b3e9f998cf3622b788ca0bc00bebd08285bf987e5fef81ea893268645ebe075c064b3e96eb0e912662766d8de53f8c03b89a084ec9357bc85b34118bc65557732901e429a42536299b9f5f70b89c55a71bda23bfb017c01c5d1d89df8aba3f294f7497b3ed3dbe98b5fab8095c865cc96bc6fdd61b9ae4b925ace5012b6278760c5088b6a17d81ae97571655375c9d5daf7b18a303b4fc1eaf685894979f69e9a1b02e8abe89e503b2ea766b66caae59e107ff9663a109ddfb9b7b1f6ad7834e8a2518a86e5d0812970fcee76fef9df81b402a455f5e14ee2496b19d3cab99ee4e8aa46c ...
Notes of ASE
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ASE 笔记
得到晶胞参数(方法一：Numpy)通过线性代数运算计算晶胞参数：
12345678910111213141516171819202122# Numpyfrom ase import Atomsimport numpy as npfrom ase.io import readatoms = read('POSCAR')# 基矢cell = atoms.celllatticelength = np.dot(cell, cell.T).diagonal()latticelength = latticelength ** 0.5cos_alpha = np.dot(cell[1], cell[2]) / (latticelength[1] * latticelength[2])cos_beta = np.dot(cell[0], cell[2]) / (latticelength[0] * latticelength[2])cos_gamma = np.dot(cell[0], cell[1]) / (la ...
Pearl
9c6161198b65c0c7ed655745c399b5b3c22b49d63312cddb0a2937408d4045fef9e62b4649d6ecf6e9f8073af0e2a97754690bb8adb982f94baeb965b7d732a251cdca5db18dfaeab133b6958a2cd1448143e2f52451725bbc885ea0c90fc3065bdcb22152b47075ef109827b6bac52d7fa64ae61c7957ab85897fc304f8853bc934dea7b7f2c3c8c31a17d3cfdcaa0e1e8bb1071a3925b9d2d0040b32ee6070aed429d22f2106e367cb25ba9ad5dc66716e12504b1ccfb9470ab45940f5adb43dfefb843ba1a6a7e6e5e709da7bd42bfefae6adad664871165ea8b85055b086c9d60d97dfd04a90fe3a935bc0a02952cd52b117f3c68991d ...
Numpy Module of Python
一、Numpy-JupyterNumpy-Basis-Operations in Jupyter Notebook