Quick Start of KGZ
图片存放 ./images/
plaintext
1 | 0. 复制文本和原图片路径至此; |
一、服务器使用
xhell 7 和 xfrp 7
账号注册
- 生成密钥(私钥+公钥)
https://blog.csdn.net/l8947943/article/details/111463910 - 公钥发给管理员,管理员开通账号
二、登录
主机名 10.158.198.162
端口 2205
输入用户名,使用密钥登录
三、基本配置
linux 命令 | |
---|---|
cd | 进入目录; cd .. 返回上级目录 |
ls | 查看文件 |
mkdir | 新建目录 |
mv | 移动 ;重命名 |
cp | 复制 |
sz | 下载 |
- tab 自动补全
sh
1 | # 初始化配置环境,只输入一次 |
- vim 编辑器使用
sh
1 | 编辑模式:在vim编辑器下敲击a, 光标所在位置编辑文字。 |
四、简单计算
INCAR
,POSCAR
,POTCAR
,KPINTS
INCAR,文件准备(文献获得)
POSCAR,MS、vesta,先保存成cif文件,再在vesta中保存成 .vasp文件
POTCAR,
pos2pot
KPOINTS,
kpoints.sh x x x
(POSCAR的 20-30 )
检查文件输入
sh
1 | checkinput.sh |
提交
plaintext
1 | qsub 48kgz.pbs |
qstat 查看任务提交情况
1. 结构优化
plaintext
1 | checkinput.sh |
自洽计算(电子计算)+ 离子计算(力收敛)
提交任务
查看计算情况
plaintext
1 | ta.sh |
查看已经计算完成的任务
plaintext
1 | cat ~/mail |
CONTCAR 为已经计算完成的结构
2. 频率计算
plaintext
1 |
|
3. bader 电荷
sh
1 | # 参数修改 |
4. PDOS
sh
1 | # 参数修改 |
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